Болят ноги от бега и лыж

Типа сурья намаскар

С нагрузками в 4 км 3 раза в неделю или даже как сейчас: 35 км на лыжах в нед?

Это довольно скромные нагрузки. Так что точно дело у вас не в израсходованном ресурсе.

Ну и заниматься надо не только бегом или лыжами, а уделять ванимание всестороннему ФУНКЦИОНАЛЬНОМУ развитию организма. Слышал ,что классификация необходимых физ качеств насчитывает аж 9 разных направлений. Все сейчас не упомню, но о базовых вы, наверняка, и сами слышали: кардиовыносливость, сила, гибкость, ловкость, координация, баланс.

Старайтесь хотя бы раз в неделю включать пару тренировок на развитие тех качеств, где у вас пробелы. Увы, одними лыжами или бегом все не покрыть. И часто из-за однотипной нагрузки и перекоса в развитии опред физ качеств могут возникать неприятные последствия для организма.

У меня , например, 3 года назад ныла спина постоянно (месяцами), я уж чего себе там только наневыдумывал, невролог спину прощупала, всякие тесты провела и сказала, чтобы я  просто работал над укреплением мышечного корсета, над стретчингом проблемной зоны. Ну и отметила, что у меня от природы необычайная подвижность лопаток, мол, это не отклонение, а моя физиологическая особенность , которая встречается крайне редко и была бы моим преимуществом, если бы я был гиманстом, например.

Я стал закачивать спину отжиманиями, подтягиваниями. И боли ушли через месяц совсем. Все три года я по возможности уделяю работе по укрпелению мыщц спины и спина  НИ разу не болела за все эти три года, а за год я набегиваю 3500 км+ -  ногами, не на лыжах. Плюс, подключил работу со скакалкой и заметно прибавил в координации и балансе, даже каденс в беге немного подрос. И после каждой тернирвоки всегда теперь у меня тщательнейшая растяжка.

К чему я все это пишу: cходите к хорошему специалисту/ам  и постарайтесь хвыделять время на проработку тех физ качеств, из-за которых у вас могут возникать текущие проблемы.

Что случилось 5 лет назад, после чего начало болеть?

По описанию, очень похоже на шинсплинт, вполне вероятно, что уже стресс - перелом, если через месяц после уменьшения нагрузки не проходит.
Довольно характерна для него боль при приседаниях, тогда как при отсутствии ударной нагрузки (по описанию, на лыжах этого нет) боль пропадает.
Автор, изучите, что такое шинсплинт, вероятно, у вас оно.  

Питание рулит (мы состоим из того, что мы кушаем), далее двигательная активность.
Никаких "ресурсов" нет и быть не может.
Суставы-связки - это хондопротекторы, но лучше домашнего холодца из лыток ещё ничего не придумали,
кушать 2 раза в неделю.
Мышечный косет обязателен - суставы что то должно держать - а это умеренная качалка с небольшими весами, 3-4 подхода на каждое упр-е, системно.
Через пару месяцев будете радоваться жизни.